期刊简介

               本刊为西南医科大学主办,经国家新闻出版署批准,向国内外公开发行的综合性医学学术期刊,其前身为《泸医资料》,创办于1973年。本刊自创办以来,得到社会各界及学院各级领导的大力支持,办刊条件和办刊水平都有较大提高。                

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  • 杂志名称:西南医科大学学报杂志
  • 主管单位:四川省教育厅
  • 主办单位:西南医科大学
  • 国际刊号:2096-3351
  • 国内刊号:51-1772/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:全区优秀学报三等奖期刊收录:万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 维普收录(中)
西南医科大学学报杂志2013年第06期

生物信息学预测小鼠转铁蛋白受体B细胞表位

张滢莹;唐霓;刘玉林

关键词:生物信息学, 转铁蛋白受体, B细胞表位
摘要:目的:预测小鼠转铁蛋白受体(transferrin receptor,TfR)的B细胞表位,为构建以TfR抗体为脑转运载体的疫苗提供基础.方法:以小鼠转铁蛋白受体基因序列为基础,按Chou-Fasman和Gamier-Robson方法预测其编码蛋白的二级结构,按Kyte-Doolittle方法预测其亲水性,Emini方法预测其表面可能性以及按Jameson-Wolf方法预测其抗原指数.结果:Chou-Fasman和Gamier-Robson方法发现90 ~110,120~145,160 ~180,240 ~ 250,265~275,290~304,336~350,375~383,426~435,504 ~517,590~602,613~ 630,710~718这些区域可能为α螺旋的中心区域.用Kyte-Doolittle、Emini、Jameson-Wolf方法分别对小鼠TfR的B细胞表位进行预测,结果显示其共有区域为30~50,100~115,145 ~ 157,310 ~320,355~ 360,440~445,510~535,655 ~ 660,690 ~ 695,705 ~ 710.根据抗原表位设计原则筛选出5段符合要求的抗原表位氨基酸序列:DGDNSH,AETEETDKS,NTYTP,MDKNKF,KHPVDGKSLYRDSNWISKV,它们可能为小鼠转铁蛋白受体的B细胞优势表位区域.结论:该结果有助于确定小鼠转铁蛋白受体的B细胞表位以及构建药物-载体复合物,发挥其脑药物转运载体的功能.